Single Nucleotide Polymorphisms in Genes for Non-Coding RNAs as Diagnostic and Prognostic Markers in Patients with Metastatic Colorectal Cancer // Единични нуклеотидни полиморфизми в гените за некодиращи РНК-и като диагностични и прогностични маркери при болни с колоректален карцином в метастатичен стадий

Abstract

Единичните нуклеотидни полиморфизми (SNPs) са често срещана генетична вариация, засягаща индивидуалната чувствителност към определени онкологични заболявания. Това е причината SNPs да се разглеждат като биомаркер за прогнозиране на риска от КРК. В хода на нашето проучване сравнихме алелните и честоти и генотипното разпределение на пет подбрани SNPs (rs7372209, rs2910164, rs2682818, rs353293 и rs322931) в гените за миРНК-ите сред българска група здрави индивиди с други здрави кохорти. Анализът на нашите резултати показа сходно честотно разпределение на изследваните полиморфизми в българските индивиди с това при европейските кохорти. Установихме асоциация с риска от развитие на КРК за три от изследваните полиморфизми в българската кохорта пациенти с метастатичен КРК (rs2910164 в гена за miRNA-146a, rs2682818 в гена за miR-618 и rs353293 в промоторния район на генния клъстер за miRNA-143 и miRNA-145). За два от изследваните полиморфизми беше установена статистически значима асоциация с общата преживяемост на пациентите (генотип TT за rs7372209-miR-26a-1 и генотип АА за rs353293 в промоторния район на генния клъстер за miRNA-143/145). В хода на изследването беше оценено и нивото в плазмата при пациенти и здрави контроли на миРНК-ите в чийто гени са локализирани изследваните в проучването полиморфизми. Четири от тях показаха различна експресия между здравите контроли и селектираните болни с висока специфичност и чувствителност - miRNA-26а-1, miR-146a, miRNA-618 и miRNA-181b.

Single nucleotide polymorphisms (SNPs) are a common genetic variation affecting individual susceptibility to certain cancers. This is why SNPs are considered a biomarker for predicting the risk of CRC. In our study, we compared the alleles, frequencies, and genotypic distribution of five selected SNPs (rs7372209, rs2910164, rs2682818, rs353293 and rs322931) in the mRNA genes among a Bulgarian group of healthy individuals with other healthy cohorts. The analysis of our results showed a similar frequency distribution of the studied polymorphisms in Bulgarian individuals with that of European cohorts. We found an association with the risk of CRC for three of the studied polymorphisms in the Bulgarian cohort of patients with metastatic CRC (rs2910164 in the miRNA-146a gene, rs2682818 in the miR-618 gene and rs353293 in the promoter region of the miRNA-143 gene cluster -145). Statistically significant associations with overall patient survival were found for two of the polymorphisms studied (TT genotype for rs7372209-miR-26a-1 and AA genotype for rs353293 in the promoter region of the miRNA-143/145 gene cluster). Plasma levels in patients and healthy controls of siRNAs in whose genes the polymorphisms studied in the study were also assessed during the study. Four showed different expressions between healthy controls and selected patients with high specificity and sensitivity - miRNA-26a-1, miR-146a, miRNA-618 and miRNA-181b.